创伤性脊髓损伤(Traumaticspinalcordinjury)是一种严重的脊髓损伤类型,直接导致运动和感觉功能的丧失。有些研究表明脊髓损伤后会导致ncRNAs(non-codingRNAs,ncRNAs)的失调,因此,ncRNAs有可能作为治疗脊髓损伤的潜在靶标。
CircRNA(circularRNAs,circRNAs)是一种典型的ncRNAs,最近研究表明circRNA在转录后水平调控基因的表达,在很多疾病中发挥着重要的作用。然而,circRNA在创伤性脊髓损伤中扮演着什么样的角色,我们知之甚少。
近日,上海第二*医大学LeiZhu和四川大学Yu-longNiu研究团队合作,利用大鼠冲击伤脊髓损伤模型,从损伤区前后取出共1.5cm长的脊髓提取RNA进行RNA-seq,然后通过生物信息学分析对差异基因进行分析。
研究结果显示,个circRNA发生明显变化,在这些差异变化的circRNA中,99个circRNA表达上调,51个表达下调。GO(Geneontology)和KEGG分析结果进一步发现circRNA-和circRNA-和脊髓损伤有关,且它们通过circRNA靶标miRNA-mRNA间的相互作用参与脊髓损伤后的病理学过程。总之,本研究揭示了在创伤性脊髓损伤中circRNA的差异表达谱,预测了差异circRNA的潜在功能。
该成果于近日发表于JournalofNeurotrauma杂志。这项研究从大数据分析的角度为今后研究脊髓损伤的机制提供了新的思路,为临床上治疗脊髓损伤提供新的潜在分子靶点。
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